画roc曲线需要的数据,在前期的文章中,我们详细讲解了用GraphPad Prism绘制柱状图和箱式图以及生存曲线图,请大家详细观看下方文章:
今天,我们就来详细讲解一下如何在GraphPad Prism中绘制ROC曲线图。
蓝色线即为ROC曲线,当曲线从左下角逐渐上升到顶部,再向右延伸到右上角时,预测效果好。如果ROC曲线延主对角线方向分布,则表示结果是随机造成的。2.2.2 曲线下方的面积(Area under the curve):包括面积值、显著性。
图1
在GraphPad Prism中绘制ROC曲线的操作步骤:
①打开GraphPad Prism软件,新建一个“Column”的表单,准备录入数据。(图2)
图2
②然后回到数据的Excel界面中,将病理列进行排序,将0和1两类区分开来。(图3)
图3
图4
图5
图6
图7
图8
图9
可以用先做分析,做出概率预测值。再根据这个值绘制roc。首先在分析列表选择ROC曲线图,输入检验变量和状态变量,如果检验变量输入多个,则会在图上显示每个检验变量的曲线。状态变量还需输入表示阳性组的数值。在输出文件中可以。
图10
图11
图12
ROC曲线,做分类时经常会用到的一种结果表现方法。诸如此类的工作,首选工具当然是R。在CRAN上搜了一下,找到一个叫ROCR的包。尽管这个包已经很久没更新了,但用起来还是很爽的。先看一下我画的ROC曲线。里面是三份预测。
【杏花开生物医药统计】微信公众号(xhkdata)
·
·
1.ROC曲线绘制。依据专业知识,对疾病组和参照组测定结果进行分析,确定测定值的上下限、组距以及截断点(cut-off point),按选择的组距间隔列出累积频数分布表,分别计算出所有截断点的敏感性、特异性和假阳性率(1-特异性。
·
·
·
·
·
·
·
根据五种先定概率得到的实验结果,就可计算击中概率和虚惊概率。最后,根据不同先定概率下的击中概率和虚惊概率,就可在图上确定各点的位置,把五点联接起来就绘成一条 ROC曲线。如下图。
·
·
·
·
·
·
1、绘制ROC曲线,首先要建立数据文件 2、依次打开菜单栏:Graphs —— ROC Curve在“ROC Curve”。主对话框中进行参数设置:(1) 在"Test Variable"框中:选入"Value";(2) 在"State Variable"框中:选入“state”;(。
·
·
·
·
·
·
·
·
·