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PyMOL官方网站上给了两个绘制坐标轴的脚本,但无法满足个人需要. 所以就照葫芦画瓢,改写了一个根据PDB中的信息绘制坐标轴和盒子的脚本.
PyMOL官方网站上给了两个绘制坐标轴的脚本,但无法满足个人需要. 所以就照葫芦画瓢,改写了一个根据PDB中的信息绘制坐标轴和盒子的脚本.
1、首先在纸上画一个长长的矩形,可以拿尺子帮助或者类似矩形的工具进行帮助。2、接着画出铅笔盒的样子,可以是参考图片,也可以参考实物。3、然后在里边画上两只铅笔,直接按照铅笔画就好了。4、接着把铅笔盒涂成蓝色,或。
PyMOL读取的盒子信息来自PDB文件中的CRYST1行,类似如下:
CRYST1 42.844 42.844 128.531 90.00 90.00 90.00 P 1 1
(1)画数轴(2)画矩形盒 两端边位置别应数据四位数矩形盒:端边位置别应数据四位数(Q1Q3)矩形盒内部位数位置画条线段位线(3)Q3+1.5IQR(四位距)Q1-1.5IQR处画两条与位线线段两条线段异值截断点称其内限。
这个脚本只能绘制简单的长方体盒子,但改成任意的六面体盒子也不困难. 因为我暂时用不到这个功能,就不再操心了.
1、首先画出一个长方体,在长方体的一个比较大的面上,画一个蝴蝶结,在旁边再画一个梯形的边。2、其次接着完整画出装饰盒子的这朵花,3、然后画出绑在盒子上并经过花的一条丝带。4、最后接着画出另一条丝带,两。
绘制出的效果类似下图,看起来还可以. 这也是我们发表的一篇文章中所用的图
箱盒图共由五个数值点构成,分别是最小观察值(下边缘),25%分位数(Q1),中位数,75%分位数(Q3),最大观察值(上边缘)。中横线:中位数 IQR:75%分位数(Q3)-25%分位数(Q1)最小观察值(下边缘) =。
打开PyMOL,在命令行中执行 load FILE.pdb; run axes.py.
脚本:
箱线图的绘制步骤:(1)画数轴(2)画矩形盒 两端边的位置分别对应数据的上下四分位数矩形盒:端边的位置分别对应数据的上下四分位数(Q1和Q3)。在矩形盒内部中位数位置画一条线段为中位线。(3)在Q3+1.5IQR(。
图文来源:Jerkwin